Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rundc1Q0VDN7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms