Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms