Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cnn1Q08091 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Cnn1Q08091 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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