Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cntn3Q07409 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cntn3Q07409 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cntn3Q07409 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cntn3Q07409 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cntn3Q07409 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cntn3Q07409 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cntn3Q07409 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntn3Q07409 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cntn3Q07409 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cntn3Q07409 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cntn3Q07409 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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