Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx2Q03358 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms