Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cacna1sQ02789 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cacna1sQ02789 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms