Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb4Q02738 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb4Q02738 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms