Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms