Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
PrcdQ00LT2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms