Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Stx2Q00262 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Stx2Q00262 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms