Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Casp7P97864 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Casp7P97864 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Casp7P97864 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Casp7P97864 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms