Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nbr1P97432 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms