Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms