Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Irx2P81066 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Irx2P81066 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms