Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ptprn2P80560 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ptprn2P80560 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms