Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chl1P70232 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chl1P70232 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chl1P70232 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms