Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vamp3P63024 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vamp3P63024 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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