Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufm1P61961 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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