Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ube2d1P61080 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ube2d1P61080 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms