Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Csrnp3P59055 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms