Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpm2P58774 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpm2P58774 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms