Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TspoP50637 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TspoP50637 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TspoP50637 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TspoP50637 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TspoP50637 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TspoP50637 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TspoP50637 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TspoP50637 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TspoP50637 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TspoP50637 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms