Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxc13P50207 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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