Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VegfbP49766 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms