Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cdkn1bP46414 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms