Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nkx1-2P42580 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkx1-2P42580 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms