Protein–RNA interactions for Protein: P42208

Sept2, Septin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept2P42208 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sept2P42208 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sept2P42208 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms