Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cap1P40124 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cap1P40124 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms