Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TtlP38585 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtlP38585 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtlP38585 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms