Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TpoP35419 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TpoP35419 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TpoP35419 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TpoP35419 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TpoP35419 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TpoP35419 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TpoP35419 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TpoP35419 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TpoP35419 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TpoP35419 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TpoP35419 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TpoP35419 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TpoP35419 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TpoP35419 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TpoP35419 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TpoP35419 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TpoP35419 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TpoP35419 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TpoP35419 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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TpoP35419 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TpoP35419 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TpoP35419 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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