Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Apoc3P33622 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Apoc3P33622 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms