Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cd28P31041 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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