Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctnnd1P30999 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms