Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Hoxd10P28359 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd10P28359 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd10P28359 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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