Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aco1P28271 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms