Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gjc1P28229 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjc1P28229 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjc1P28229 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms