Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PdgfraP26618 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PdgfraP26618 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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