Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P20040 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P20040 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P20040 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms