Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CtsdP18242 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms