Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata1P17679 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gata1P17679 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms