Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptbp1P17225 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms