Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lmnb1P14733 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms