Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vpreb1P13372 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms