Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chrm1P12657 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms