Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calm3P0DP28 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms