Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P01641 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P01641 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P01641 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P01641 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
P01641 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
P01641 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
P01641 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
P01641 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
P01641 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
P01641 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
P01641 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P01641 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms