Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops6O88545 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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