Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lnx1O70263 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lnx1O70263 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms