Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gjd2O54851 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms