Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Psmb10O35955 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Psmb10O35955 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Psmb10O35955 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Psmb10O35955 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Psmb10O35955 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Psmb10O35955 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms